聖カピタニオ女子高等学校の入試難易度は、普通コースと英語コース（※設置コースの改編・展開状況を含む）によって異なります。主要な教育系リサーチデータによると、全体の偏差値帯はおおむね47〜55となっており、基礎学力をしっかりと身につけた受験生が手堅く合格を狙える難易度設定です。
愛知県内の高校入試において、私立女子高校の推薦入試比率は年々高まる傾向にあります。同校でも推薦入試を利用して早期に進路を決定する受験生が多く、中学校の通知表評定（内申点）を安定して確保しておくことが合格への最短ルートとなります。一般入試の倍率自体は極端な高倍率にはなりにくいものの、基礎学力の定着度を測る設問が中心となるため、ケアレスミスを防ぐ実践演習が必須です。
進路面における最大の強みは、私立大学を中心とした指定校推薦枠の厚さにあります。カトリック教育の連携枠や地元東海エリアの有力私立大学（南山大学、愛知淑徳大学、金城学院大学、椙山女学園大学など）への推薦ルートが確立されており、一般選抜の一発勝負を避け、高校3年間の真面目な学習態度を評価されて希望進路を掴み取る生徒が多数を占めています。
