登録販売者試験の最大の特徴は、国家資格でありながら試験の実施主体が各都道府県（実際には広域ブロックごと）に委ねられている点にあります。この仕組みが、受験生を悩ませる「地域ごとの難易度格差」を生み出しています。
全国は主に「北海道・東北」「関東・甲信越」「東海・北陸」「関西広域連合（福井・滋賀・京都・大阪・兵庫・和歌山・徳島）」「中国」「四国」「九州・沖縄」などのブロックに分かれ、それぞれ異なる日程および試験問題で実施されます。過去のデータを精査すると、同一年度であっても合格率が50％を超えるブロックがある一方で、別ブロックでは20％台後半〜30％台前半にまで落ち込むという深刻な乖離が毎年のように発生しています。
「関西ブロックは問題の癖が強く難しい」「関東ブロックは標準的な出題が多い」といった受験生間の噂は単なる都市伝説ではなく、各ブロックの問題作成委員が重視する出題傾向や、難問・奇問の混入率の違いが直結しているのが現実です。居住地以外のブロックでも受験が可能なため、合格率や出題傾向をリサーチした上で隣県へ遠征受験する戦略をとる受験者も珍しくありません。
資格全体の難易度相場を示す指標として、各種資格スクールが提示する登録販売者の偏差値ランキングでは、おおむね偏差値45〜48程度に位置付けられます。他資格との相対比較で見ると、ITパスポート（偏差値45前後）や危険物取扱者乙種4類（偏差値46前後）と同等のゾーンにあり、宅地建物取引士（偏差値57前後）や日商簿記2級（偏差値58前後）よりはハードルが低いといえます。とはいえ、「ノー勉強で受かる試験」では決してなく、大学受験レベルの生物・化学の基礎語彙や膨大な薬理成分名を系統立てて暗記する知力と忍耐力が求められます。
