動物病院で処方された薬を塗っているにもかかわらず、犬のマラセチア性外耳炎が何度もぶり返してしまう背景には、単なる「真菌のしぶとさ」だけではない構造的な問題が存在します。マラセチア（Malassezia pachydermatis）自体は、健康な犬の皮膚や外耳道にもごく普通に存在する常在菌です。健康な状態であれば悪さをすることはありませんが、耳内の常在菌バランスが崩れ、皮脂分泌の増加や湿度の急上昇が起きた瞬間に爆発的な増殖を始めます。
愛犬の犬の耳のマラセチアが治らない理由として、獣医師が現場で最も頻繁に直面するのが以下の3大要因です。
第一に、「基礎疾患の未解決」です。マラセチアの過剰増殖は、何らかの基礎疾患によって引き起こされる「二次感染」であることが大半を占めます。代表的なものが犬のアトピー性皮膚炎による耳の痒みや、食物アレルギー、あるいは甲状腺機能低下症などの内分泌疾患です。これらによって皮膚のバリア機能が低下し、皮脂分泌が過剰になっている限り、いくら抗真菌薬でマラセチアを一時的に叩いても、投薬をやめた途端に再増殖を許してしまいます。
第二に、「投薬の自己判断による早期中断」が挙げられます。痒みが治まり、耳垢が目立たなくなった段階で投薬をやめてしまうと、外耳道の深部に潜んでいた菌が生き残り、わずか数日で再び増殖します。顕微鏡下で菌数がゼロ近くまで減少したことを獣医師が確認する「真の治癒」まで治療を継続しなければ、耐性化や慢性化のリスクを高める結果となります。
第三に、「耳道構造の慢性的な変化とバイオフィルム形成」です。炎症を何度も繰り返した外耳道は、皮膚が厚く肥厚して狭窄し、耳内の換気がさらに悪化します。加えて、増殖した菌が粘着性の高い生体膜（バイオフィルム）を形成すると、通常の点耳薬の成分が深部まで浸透しにくくなり、治療への反応性が著しく低下します。
