これほど高感度なNAT検査をもってしても、乗り越えられない生物学的な壁が存在します。それが「ウインドウ期間（検査空白期間）」の存在です。
人がHIVに感染してから、体内でウイルスが増殖して血液中の核酸が検査機器の検出感度を超えるまでには、どうしても数日〜1週間前後のタイムラグが生じます。この期間は、どれほど世界最新の機器で精密検査を行ってもウイルスの痕跡を捉えることができません。このウインドウ期間にある血液が採血され、検査をすり抜けて患者へ輸血されてしまうことこそが、現在残されている最大の感染要因です。
なお、混同されがちですが、感染してから発熱などの初期症状やエイズを発症するまでの「潜伏期間（数年〜十数年）」と、検査機器でウイルスを捕捉できない「ウインドウ期間（数日間）」は全く異なる概念です。潜伏期間中であってもウイルスは血中に十分に存在するため、ウインドウ期間を過ぎていればNAT検査で確実に検知されます。
そして、このウインドウ期間の脆弱性を意図的に突いてしまう深刻な社会問題が、献血HIV検査目的の来所です。
SNSやネット掲示板では今なお、「保健所に行くのが面倒だから献血でタダで検査してもらおう」「献血すれば通知ハガキで感染がわかる」といった悪質な誤解が散見されます。しかし、日本赤十字社はHIVに関する検査結果を献血者本人に一切通知していません。これは「検査目的の受検者が集まれば、ウインドウ期間のすり抜け確率が跳ね上がり、血液製剤の安全性が根底から崩壊する」という世界共通の疫学的防衛策です。
危険な性交渉や血液曝露の直後に献血ルームを訪れる行為は、善意の医療システムを破壊し、輸血を受ける罪のない患者を生命の危機に晒す極めて無責任な行為にほかなりません。HIVの感染確認を行いたい場合は、各地の保健所や自治体が実施している無料・匿名の抗体検査、あるいは民間の郵送検査キットを利用するのが鉄則です。
