生活習慣や心因性以外にも、卵巣そのものの疾患が隠れているケースがあります。代表的なものが、生殖年齢の女性に多く見られる多嚢胞性卵巣症候群（PCOS）です。卵胞が卵巣の表面で育ちきれずに多数とどまり、排卵障害を引き起こす体質的な疾患で、月経不順や無月経の大きな原因となります。このほか、甲状腺ホルモンの異常や、母乳を分泌させるプロラクチンが高くなる高プロラクチン血症なども視野に入れて鑑別を行います。
医療機関での初診時には、問診・超音波（エコー）検査・採血によるホルモン値測定が行われます。保険適用（3割負担）の場合、検査費用の総額はおよそ4,000円〜8,000円前後（初診料・処方箋料別）が一般的な相場です。自分の体が今どのようなホルモン状態にあるのかを客観的に把握することが、根本的な解決への近道です。
