大手フィットネスクラブのトレーナー陣への聞き取り調査や、SNS・コミュニティサイト（知恵袋、5ちゃんねる等）で交わされる生々しい体験談を精査すると、初心者が直面するトラブルには明確な共通項が存在します。
最も深刻なのは、ホエイプロテイン導入後に起きる消化器トラブルです。ネット上には「健康のためにホエイを飲み始めた途端、激しい腹痛とおならの悪臭に悩まされ、通勤電車に乗るのが怖くなった」という告白が散見されます。この主因は、日本人の約7割から8割が該当するとされる「乳糖不耐症お腹下す」問題に他なりません。
安価なWPC（ホエイプロテインコンセントレート）製法では牛乳に含まれる糖質「乳糖（ラクトース）」が残存するため、体内の消化酵素「ラクターゼ」が不足している人は小腸で分解できず、大腸でガスが発生して浸透圧性下痢を起こします。フィットネス現場で取材したパーソナルトレーナーは、「体質的に乳製品が合わないクライアントには、無理にホエイを推さず、WPI（アイソレート）への切り替えか、最初からソイを選択するよう指導するのが鉄則」と明かします。
一方で、ソイプロテインを選択した層からは「粉っぽくて喉越しが重く、砂を飲んでいるようで3日でギブアップした」「シェイカーの底に溶け残り、洗うのが億劫」といったテクスチャー（食感）面での不満が噴出しています。2026年現在の加工技術によって微粒子化は大幅に進展したものの、依然として水溶性のホエイに比べると特有のざらつきを感じる人は少なくありません。
