神秘的な存在として崇められる一方で、動物医学の観点からは慎重なケアが求められる存在です。臨床獣医師の指摘によると、オスの三毛猫の寿命と健康リスクには特有の課題が横たわっています。
クラインフェルター症候群（XXY）を抱えるオス猫は、ホルモンバランスの不均衡や免疫機能の脆弱性を抱えやすい傾向が報告されています。停留睾丸（陰睾）のリスクが高く、体内に残った精巣が腫瘍化する恐れがあるため、適切な時期における開腹手術を伴う去勢が推奨されます。また、一般的な猫種に比べて心疾患や糖尿病などの内分泌系疾患の罹患リスクに配慮が必要であり、一般的な雑種猫の平均寿命（15年前後）に比べて短命に終わる個体も散見されます。もちろん、適切な獣医療管理のもとで天寿を全うする個体も存在しますが、「希少＝頑強」という認識は明白な誤謬です。
また、保護猫活動の現場や一般家庭で子猫が生まれた際、誤認が非常に多いのがオスの三毛猫の見分け方です。
- 生殖器の形状と肛門との距離：肛門と生殖器の開口部の距離を確認します。メスは距離が近く縦のスリット状ですが、オスは距離が離れており丸い形状をしています。ただし、XXYの個体は精巣が極めて小さく目立たないため、幼少期はメスと誤認されやすい傾向があります。
- 被毛色の厳密な識別：サビ猫（トーティシェル）のように黒と茶が細かく混ざり合った毛色や、キジトラの茶色部分をオレンジと誤認するケースが多発しています。学術的に真の三毛猫（キャリコ）とされるのは、「純白」「明瞭な黒」「明瞭なオレンジ（茶）」の3色が独立した斑状に現れている個体に限られます。
- 染色体検査（確定診断）：外見だけで100％の断定を下すことは極めて困難です。遺伝的確定診断を下すには、動物病院を通じて外部検査機関へ依頼する性染色体の血液検査（DNA検査）が不可欠となります。
