病院で抗菌薬（抗生物質）を処方された際、ミヤBM錠が同時に出されるケースが非常に多く見られます。これには、宮入菌ならではの生物学的特性に基づいた明確な理由が存在します。
抗生物質を服用すると、病原菌だけでなく腸内に生息する有益な善玉菌まで広範囲に死滅してしまい、腸内バランスが崩れて急激な下痢（薬剤性下痢症）を引き起こすリスクが高まります。一般的な乳酸菌やビフィズス菌は抗生物質の攻撃に弱く死滅しやすいのに対し、宮入菌は「芽胞（がほう）」と呼ばれる極めて強固な天然のカプセル状構造を持っています。
この芽胞によって保護された宮入菌は、ペニシリン系やセフェム系など多くの抗生物質の存在下でも生き残り、大腸まで到達して腸内環境の破綻を最小限に食い止めます。これが、医療現場で抗生物質投与時のファーストチョイスとしてミヤBMが選ばれる理由です。
