神戸医療センターの大きな強みは、幅広い疾患を網羅する充実した診療科一覧と、各分野における専門性の高さにあります。内科系（総合内科、消化器内科、循環器内科、呼吸器内科、糖尿病・内分泌内科など）から外科系、小児科、産婦人科、皮膚科、眼科、耳鼻咽喉科、放射線科、リハビリテーション科まで高度な医療を提供しています。
とりわけ全国的にも名高いのが「整形外科」です。脊椎・脊髄疾患、人工関節置換術、スポーツ障害、関節リウマチなど、各サブスペシャルティに精通した熟練の医師が在籍しており、低侵襲な手術や早期社会復帰を目指すリハビリテーション連携に定評があります。
また、予防医療分野では健康管理センターによる「人間ドック・各種健診」が稼働しています。日帰り標準コースから脳ドック、肺がん検診、レディース検診などのオプション検査が用意されており、事前予約制でスムーズに受診できます。万が一異常所見が見つかった場合でも、院内の専門診療科へ迅速に精密検査・治療連携が行われる点が総合病院ならではの大きな安心材料です。
