宿泊時に楽しみにしたいのが食事のクオリティです。尾道みなと館の朝食は、瀬戸内の新鮮な海の幸や地元産の野菜をふんだんに取り入れた和洋プレートスタイル。炊きたてのご飯に合う優しい味付けのおかずが並び、「朝からエネルギーが湧いてくる」「派手さはないが滋味深い味わい」と口コミでも好意的な感想が目立ちます。
館内レストランやカフェスペースでは、日帰り利用者向けにランチ営業や軽食メニューが提供されることもあり、湯上がりのクラフトビールや尾道レモンを使ったドリンクが好評です。また、宿の周辺には尾道ラーメンの老舗店や瀬戸内海鮮を味わえる名店居酒屋がひしめき合っているため、夕食は街に出て地元の食文化を堪能するスタイルが定番となっています。