育児中の親が最も知りたい「結局、何歳から飲ませていいのか」という問いに対し、株式会社ヤクルト本社の公式Q&Aでは「離乳食を始める頃（生後5〜6ヶ月頃）から」与えて構わない旨が明確に記載されています。母乳や育児用ミルク以外の水分や食物を口元へ受け入れ始めるこの時期であれば、食品衛生法上の「乳製品乳酸菌飲料」であるヤクルトを摂取しても、消化管構造上の重大な拒絶反応は起こりにくいと判断されているためです。
生後5〜6ヶ月の乳児は、胎盤や母乳を通じて母親から受け取った移行抗体が徐々に減少し、自前の免疫システムを立ち上げ始める移行期にあたります。腸管内ではビフィズス菌を中心とした乳児特有の細菌叢が形成されつつありますが、離乳食の進展に伴って腸内環境は激変します。ヤクルトに含まれる乳酸菌シロタ株（L. カゼイ YIT 9029）は、胃液や胆汁といった強い消化液に屈することなく生きたまま腸内に到達し、ビフィズス菌を増やして悪玉菌の増殖を抑える生理活性が確認されています。
ただし、公式見解が「飲ませてもよい」としているのは、あくまでアレルギーなどの安全基準をクリアしているという前提に過ぎません。大人が飲むのと同じ感覚で原液のまま与えてよいという意味ではない点に、育児現場での最大の誤解が潜んでいます。
