今回の捜査で最大の突破口となったのは、警察庁のデジタルフォレンジック捜査機関による高度な電子機器解析だった。父親が提出したスマートフォンやパソコンのドライブからは、男児が行方不明になった直後のGPS位置情報データやメッセージアプリの送信履歴が、意図的に消去された形跡が検出された。
復元されたデータの中には、事件発生の数日前から頻繁に検索されていた不自然なワードや、深夜における密かな移動軌跡が含まれていた。デジタル上に残された不都合な痕跡は、父親の「ずっと家にいた」という主張を根底から覆す動かぬ証拠となりつつある。
