高校選択において最大の関心事となるのが進学実績と内部進学のルートです。阪南大学高等学校の卒業生の進路は、進学先の多様性と附属校ならではの利点を兼ね備えています。
まず、総合進学コースの生徒にとって大きなアドバンテージとなるのが、併設校である阪南大学への内部推薦制度です。一定の評定平均と出欠状況を維持していれば、優先的に希望学部（流通学部、経済学部、経営情報学部、国際学部、国際観光学部）へ進学できます。受験ストレスを回避して高校生活での部活動や課外活動に打ち込める点は、附属校特有の魅力です。
一方で、文理特進コースを中心に、他大学への外部進学実績も伸長しています。近年の合格実績データでは、以下のような大学への進学者が確認されています。
- 関関同立：関西大学、関西学院大学、同志社大学、立命館大学
- 産近甲龍：近畿大学、京都産業大学、甲南大学、龍谷大学
- その他中堅私立・医療系：摂南大学、神戸学院大学、追手門学院大学、桃山学院大学、各種医療看護系専門・大学
学校側も放課後補習や個別添削、進学講習をカリキュラム内に組み込んでおり、「予備校に頼りすぎない受験指導」を掲げた体制づくりを進めています。
