JR武蔵小杉駅を利用した誰もが一度は抱く疑問が、「南武線と横須賀線のホームがなぜこれほど離れているのか」という点です。実際に両線を結ぶJR武蔵小杉 横須賀線 南武線 連絡通路は全長約400メートルに及び、階段や動く歩道を経由して大人の足でも標準で6〜8分、混雑時には10分近くを要します。
この極端な構造が生まれたJR武蔵小杉駅 乗り換え 遠い 理由は、駅の歴史的な成り立ちにあります。もともとこの地にあったのは、1927年に開業した南武鉄道（現・JR南武線）の駅でした。その後、周辺の工場跡地が再開発され人口が急増したことを受け、2010年に横須賀線・湘南新宿ラインの停車駅が新設された経緯があります。
しかし当時、南武線に隣接する敷地には新幹線と貨物線（品鶴線）が並行して走っており、直近に新たなホームを敷設する物理的な空間がありませんでした。さらに、川崎寄りに近接する新川崎駅との駅間距離（約1.5km）を確保する必要があったため、やむを得ず南武線ホームから南東へ約400メートル離れた位置に横須賀線ホームが建設されたのです。
初めて訪れる利用者がJR武蔵小杉駅 構内図 わかりやすい案内板を求めて立ち止まる光景が日常化しているのは、実質的に「別の場所にあった2つの駅を1本の長いトンネルで無理やりつないだ構造」になっているためです。
