日本史上で最も御落胤の伝説が集中しているのが徳川将軍家です。なかでも開祖である徳川家康の周辺には、真偽入り混じる膨大な記録が残されています。
史実として確定している最も有名な事例は、家康の次男である結城秀康です。母は家康の側室であった於万の方（小督局）ですが、正室である築山殿の機嫌を恐れた家康によって、秀康は城外で密かに産み落とされました。幼少期は家康から認知されず、対面すら許されなかったという逸話は『藩翰譜』などの記録にも残る事実です。のちに兄の信康が切腹したことで存在が浮上し、羽柴秀吉への養子入りを経て越前福井藩の祖となりました。この秀康の境遇こそ、絵に描いたような御落胤の軌跡と言えます。
一方で、完全な虚構や陰謀論の領域に属するエピソードも少なくありません。その筆頭が、八代将軍・徳川吉宗の御落胤を名乗った「天一坊（てんいちぼう）事件」です。享保14年（1729年）、山内伊賀介らと共謀した僧侶・源氏坊が「自分は吉宗が紀州藩主時代に生ませた落胤・徳川天一坊である」と吹聴し、偽の墨付を掲げて大名や商人から多額の金品を詐取しました。最終的には町奉行の大岡忠相（または関東郡代ら）の徹底した吟味によって嘘が暴かれ、天一坊は処刑されるに至ります。この事件は、御落胤という看板が持つ絶対的な権威と、それを悪用しようとする詐欺師の親和性を如実に示しています。
また、徳川幕府の黒幕として名高い怪僧・南光坊天海をめぐっても、「明智光秀の生き残り」という俗説と並び、「足利十三代将軍・足利義輝の御落胤説」が古くから囁かれてきました。天海自身の生年や出自が徹底して秘匿されていたため、その圧倒的な政治力と朝廷とのパイプを説明づけるために、高貴な血統の後ろ盾が後世の歴史ファンや講談師によって創り上げられた典型例と言えます。
