訓令式とヘボン式の最大の違いは、「日本語の音韻体系に忠実か」「外国人が発音しやすいか」という思想の差にある。訓令式は「さしすせそ」を「sa, si, su, se, so」と規則的に並べる。日本語の構造としては美しいが、英語圏の人々が「si」を見ると「スィ」と発音してしまいがちだ。
一方でヘボン式は「shi」と書く。英語の「she」に近い発音になるため、外国人にとって直感的だ。「ち」を「ti」とするか「chi」とするか、「つ」を「tu」とするか「tsu」とするかも同様である。今回の統一は、日本が「内向きの論理」を捨て、「外からどう見えるか」という実用性を選択したことを意味している。