佐賀駅から鳥栖駅へ向かう利用者の多くは、鳥栖駅を終着点とせず、そこからJR鹿児島本線へ乗り換えて博多方面や久留米・大牟田・熊本方面へ向かいます。
鳥栖駅は九州最古の歴史を持つ鉄道のジャンクションであり、複数の中線とホームが並びます。長崎本線から鹿児島本線上り（博多方面）や下り（久留米方面）への乗り換えは、階段やエレベーターを利用した跨線橋の移動が発生するケースが一般的です。
乗り換え標準時間は通常3〜5分程度確保されていますが、通勤ラッシュ時間帯や大きな荷物を持っている場合は、移動に余裕を持った乗り継ぎ列車を選択するのが賢明です。なお、特急「リレーかもめ」や「みどり」の多くは鳥栖駅からそのまま鹿児島本線へ直通して博多駅まで直通運転するため、博多が目的地であれば鳥栖駅で下車せずそのまま乗り続けるのが最も快適です。
