「整腸剤は食前に飲むべきか、それとも食後か」という疑問は、患者から薬局の窓口へ最も多く寄せられる質問の1つです。結論から言えば、ミヤBMを最も効果的に腸内へ届ける推奨タイミングは「食後（食後30分以内）」です。
宮入菌は強固な芽胞を持つため、空腹時の強酸性の胃液（pH1.2前後）にも耐えうる頑強さを誇ります。したがって、仮に食前に服用したとしても菌が死滅する心配はほとんどありません。しかし、食後は胃に入った食物によって胃酸が中和され、胃内pHが4〜5程度まで上昇します。さらに、消化管の蠕動運動によって食物とともにスムーズに小腸・大腸へと運ばれるため、「食後服用のほうが菌の生存率と腸内定着率を最大化できる」というのが消化器薬理学の統一見解です。
日常の服用における注意点として、熱いお茶やスープ（50℃以上）で同時に流し込む行為は避けてください。芽胞状態の宮入菌は熱に強い性質を持つものの、熱湯に近い高温環境下では生菌活性が低下するリスクがあります。必ず常温の水、またはぬるま湯で服用することが鉄則です。
