天井裏から異音がする、外壁に黒い糞が落ちているといった場合でも、力任せに退治しようとするのは禁物です。コウモリは「鳥獣保護管理法（鳥獣の保護及び管理並びに狩猟の適正化に関する法律）」によって保護されており、一般人が許可なく捕獲・殺傷することは法律で禁止されています。違反した場合には1年以下の懲役または100万円以下の罰金が科される可能性があります。
そのため、一般家庭で行うべきコウモリの駆除・撃退法は「殺す」のではなく「追い出して塞ぐ」ステップが基本となります。
ステップ1：忌避剤を用いた追い出し
夕方の活動開始時間（日没前後）に合わせ、市販のコウモリ専用忌避スプレー（主成分：天然ハッカ油など）やくん煙剤を天井裏や隙間に噴射し、外へ逃げ出させます。
ステップ2：侵入経路の徹底封鎖
すべての個体が外に出たことを確認した後、通気口には金網や防鳥ネットを取り付け、外壁や換気口周りの隙間はシーリング材やパンチングメタルで完全に塞ぎます。この再侵入防止策を怠ると、数日後には元の状態に戻ってしまいます。
ステップ3：死骸や糞の安全な清掃
万が一屋内で息絶えていた場合のコウモリの死骸の処理方法としては、決して素手で触れてはなりません。ゴム手袋とマスクを二重に着用し、トングやホウキを使ってビニール袋へ密閉・廃棄します。その後、周辺箇所を次亜塩素酸ナトリウムやエタノール消毒液で徹底的に除菌してください。
