ルパートの私生活における最大のトピックといえば、パートナーとの深い絆と子育てです。彼のパートナー(事実上の妻)は、青春コメディ映画『ジョージアの日記/ゆーうつでキラキラな毎日』の主演で一躍有名になったイギリス人女優のジョージア・グルーム(Georgia Groome)です。
ふたりの交際は2011年頃からスタートしており、10年以上の歳月をかけて強固な信頼関係を育んできました。派手な交際アピールを避け、静かに愛を育んできたふたりですが、2020年5月には待望の第1子となる長女ウェンズデー(Wednesday G. Grint)ちゃんが誕生しました。
娘の誕生以降、ルパートは「父親になったことで人生の優先順位が完全に変わった」と明かしており、おむつ替えや寝かしつけなど育児に積極的に参加する良きパパぶりを発揮しています。夜更かしをして音楽を聴いたり映画を観たりしていたかつての生活から一変し、早寝早起きのヘルシーな生活リズムを楽しんでいる様子がインタビューでも語られています。