現地を訪れる際に最もトラブルになりやすいのが駐車場問題です。ネット上の古い情報や曖昧なまとめ記事では、「松本市立博物館の駐車場あり」と誤認させる記述が見受けられますが、事実は異なります。
新・松本市立博物館の敷地内には、一般来館者用の専用駐車場は用意されていません（身障者用および公用スペースのみ）。車で来館する場合は、近隣の市営有料駐車場または民間コインパーキングの利用が前提となります。
推奨される周辺駐車場：
1. 市営大手門駐車場（松本市大手2丁目）
博物館まで徒歩約3〜4分の近さに位置する大型自走式立体駐車場です。収容台数が多く、大名町通りへのアクセスも極めてスムーズです。
2. 市営中央駐車場（松本市中央2丁目）
中町通りや縄手通り方面からの散策を兼ねる場合に便利な拠点です。博物館までは徒歩約6〜7分程度となります。
公共交通機関を利用する場合、JR松本駅お城口（東口）から徒歩約15分です。松本市街地周遊バス「タウンスニーカー」北コースを利用すれば、「大名町」または「松本城・市役所前」バス停下車すぐでアクセス可能です。
