選手として頂点を極めた有森裕子を次に待ち受けていたのは、プライベートにおける激動でした。1998年、彼女はアメリカ人の元ダンサーであり英語講師を務めていたガブリエル・ウィルソン（Gabriel Wilson）氏との電撃結婚を発表します。米コロラド州ボルダーで合宿生活を送っていた際に出会った2人の国際結婚は、世間を驚嘆させました。
しかし、婚約直後に行われた異例の記者会見は、日本中に前代未聞の衝撃をもたらします。会見の席上、元夫のガブリエル氏が過去に男性と交際していた事実を告白し、自らのセクシャリティについて「I was gay（かつて同性愛者だった）」と公言したのです。有森は動じることなく「彼が過去に誰を愛していようと、今の彼が好き」と堂々と語り、手をつないで笑顔を見せました。
しかし、結婚生活の実態は決して平穏なものではありませんでした。日米間を行き来する多忙な生活、文化的な価値観の不一致、さらには週刊誌等による元夫の金銭トラブルや借金問題の報道が過熱。次第に2人の生活には決定的な溝が生じるようになります。
結婚から数年後には事実上の別居状態となり、お互いの人生を尊重するための協議が長期にわたって続けられました。そして2011年、2人は離婚することを公表（2012年に正式成立）。結婚から約13年間の歳月を経て、夫婦関係に終止符が打たれました。
離婚の直接的な理由について、有森は自著や単独インタビューの中で「お互いがそれぞれの人生を自立して歩むため」「夫婦という枠組みに縛られず、個人の生き方を尊重した結果」と語っています。泥沼の法廷闘争ではなく、時間をかけて話し合った上での円満な解消であったことが明かされています。
なお、ネット上で頻繁に検索される「子供」についてですが、有森裕子とガブリエル氏の間に子供はいません。多忙を極める現役生活、プロランナーとしての重圧、そして別居生活が続いた背景もあり、子供をもうける選択はせず、自らの情熱をパラスポーツや社会貢献、後進の育成に注ぎ込む人生を選び取っています。
