医学教育の核心となる臨床実習環境において、東京慈恵会医科大学は国内有数の陣容を誇ります。東京都港区に位置する西新橋キャンパスは、霞が関や新橋・虎ノ門に隣接し、都心の中核的高度医療を担う東京慈恵会医科大学附属病院（本院：約1,000床）と直結しています。
慈恵医大の臨床ネットワークは、本院のみにとどまりません。東京都および千葉県に展開する以下の4つの附属病院群が有機的に連携し、合計で約2,700床超のスケールを形成しています。
- 東京慈恵会医科大学附属病院（港区西新橋）：特定機能病院として高度先進医療、希少疾患、がん医療の中核を担う。
- 葛飾医療センター（葛飾区青戸）：地域中核病院として救急医療や総合診療の最前線を提供。
- 第三病院（狛江市和泉本町）：多摩南部・世田谷地域の急性期医療からリハビリまでをカバー。
- 柏病院（千葉県柏市）：東葛・北総地域における高度急性期医療および地域がん診療連携拠点病院。
この広範な病院ネットワークにより、学生は高度先端医療から地域プライマリ・ケアまで、偏りのない多様な症例を経験できます。卒後の就職・臨床研修先としても附属病院群の人気は極めて高く、自院研修のみならず、聖路加国際病院や虎の門病院、国立国際医療研究センターといった名門市中病院へのマッチング実績でも圧倒的な強さを示しています。
