作中最大のどんでん返しであり、読者にトラウマを植え付けた核心が、花園花鈴の正体と九条和音の過去に隠された秘密です。物語が進むにつれ、花鈴は単なる孤児ではなく、天才科学者・九条和人教授の亡き妻である「九条鈴花」が記憶を失い幼児化した姿であることが判明します。
さらに過酷なのは、花鈴のパートナーとして常に彼女を守り続けてきた九条和音の存在です。和音は教授の息子などではなく、「九条和人教授自身が自らの遺伝子から生み出したクローン」でした。つまり、小学生活を送る花鈴と和音は、実質的に「記憶を奪われた妻」と「夫のクローン」という極めて歪で倫理を超越した関係性だったのです。
加えて、和音には神化の力を行使するたびに身体が崩壊していく「極端な短命」という過酷な宿命が課せられていました。吐血しながらも花鈴を守るために命を削る和音の姿は、当時の読者に強烈な切なさと恐怖を刻み込みました。
