ジパング倶楽部に入会するにあたって、最大の関心事は「ジパング倶楽部 年会費を払っても本当にお得になるのか」という費用対効果の点です。個人会員の年会費は3,840円（税込）に設定されています。これに対し、提供されるジパング倶楽部 割引率は、JR線を片道・往復・連続で201キロ以上利用する場合に運賃・特急料金などが最大30%割引（新規入会時の1〜3回目は20%割引、4回目以降および更新後は初回から30%割引、年20回まで）となります。
具体的な損益分岐点を検証してみましょう。例えば、新大阪〜東京間を「ひかり」指定席で往復した場合、通常期の正規料金は約30,000円です。これが30%割引になると約9,000円が浮く計算となり、たった1往復するだけで年会費3,840円を軽々と回収し、約5,000円以上プラスになります。山陽新幹線区間（新大阪〜博多など）や、北陸新幹線を利用して関西から金沢・富山・長野方面へ向かう場合でも、往復1回の利用で年会費を相殺できるケースがほとんどです。
さらに年会費の元を効率よく取る裏ワザとして、「乗車券の有効期間を活かした連続乗車券の活用」や「一筆書きルートでの途中下車旅」が挙げられます。片道201キロの条件を満たせば、行き先を複数組み合わせた長距離ルートでも乗車券全体に30%割引が適用されるため、遠方への温泉巡りや複数都市を跨ぐ周遊旅行では数万円単位の節約効果を生み出します。
