藤本愛妃選手を語る上で欠かせないのが、スポーツ界でも屈指の華麗なる家族構成です。彼女が持つ傑出した身体能力と勝負強さは、幼少期からの家庭環境とアスリートの血筋に裏打ちされています。
父親は、かつてオリックス・ブルーウェーブなどで捕手として活躍した元プロ野球選手の藤本俊彦氏です。プロの厳しい世界で培われた勝負へのメンタリティやプロ意識は、幼い頃から父の背中を通じて自然と刷り込まれてきました。さらに母親も元バレーボール実業団選手という、まさにサラブレッドの家系です。
そして、2歳年下の実妹はENEOSサンフラワーズに所属する藤本愛瑚(まこ)選手です。妹の愛瑚選手も名門・桜花学園高校からトップリーグへと進み、3人制・5人制の日本代表候補にも名を連ねるトッププレイヤーへと成長しました。Wリーグの公式戦で繰り広げられる「藤本姉妹対決」は、リーグ屈指の注目カードとしてファンの胸を熱くさせています。