閉店のニュースが報じられた直後から、SNSやネット掲示板には別れを惜しむ声が殺到しました。Twitter（現X）では「沖縄の知の拠点が失われる」「大学の研究や論文執筆はどうすればいいのか」「子どもの頃からの思い出の場所」といった投稿が相次ぎ、トレンド上位を席巻し続けました。
特に専門書や学術書、そして沖縄本（琉球・沖縄関連の郷土資料）の充実ぶりは他店を圧倒していたため、教育関係者やクリエイター、医療・法律従事者からの喪失感は極めて深刻でした。「ジュンク堂に行けばどんなマイナーな専門書も手に入る」という絶対的な信頼があったからこそ、ネット上の反応は単なる名残惜しさを超え、地域文化の衰退を危惧する切実な議論へと発展しました。
また、利便性の面でも多くの支持を集めていました。沖映通りに位置し、周辺のジュンク堂那覇駐車場提携サービスを利用して週末にまとめ買いをしていたファミリー層やビジネスパーソンからも、「車社会の沖縄においてアクセスしやすく、数時間じっくり本を選べる貴重な空間だった」と惜しむ声が寄せられました。
