本シリーズが格闘ゲーム界で独自の地位を築き上げた大きな要因は、対戦ツールとしての完成度だけでなく、群像劇としてのストーリー時系列の重厚さにあります。その中核に存在し続けるのが、草薙京と八神庵の因縁です。
物語の根底には、およそ1800年前に地球意思「オロチ」を封印した三種の神器（草薙・八尺瓊・八咫）の伝説が存在します。660年前、オロチの力を欲した八尺瓊（後の八神）が草薙と袂を分かち、血の契約を交わしたことから両家の呪われた宿命が始まりました。単なるライバル関係にとどまらず、「背負った血の宿命と個人のアイデンティティとの葛藤」を描いた点こそが、多くのファンを引きつけて離さない人気の理由です。
シリーズの物語は、以下のように明確なサーガ（章）として時系列が進んでいます。
- オロチ編（'95〜'97）：草薙京と八神庵の対立、そして宿敵オロチの復活を阻止するための三種の神器（草薙京・八神庵・神楽ちづる）の共闘を描いたシリーズ初期の頂点。
- ネスツ編（'99〜2001）：京のクローンを生み出した巨大秘密組織「ネスツ」に立ち向かう、改造人間「K'（ケイダッシュ）」を新主人公に据えたSF色の強い章。ストライカーシステムの導入など意欲的な試みがなされた。
- アッシュ編（2003〜XIII）：三種の神器の力を次々と強奪する謎の青年「アッシュ・クリムゾン」の暗躍を描く。従来の正統派主人公像を覆すピカレスク・ヒーローの物語として衝撃的な結末を迎えた。
- シュンエイ編（XIV〜XV）：幻影を操る少年「シュンエイ」を軸に、空間の歪みによって過去に命を落とした強者たちが次々と復活を果たす現行サーガ。
膨大なキャラクター一覧を眺めると、格闘スタイルや所属チームの変遷を通じて、各キャラクターが背負う背景や人間関係の機微が緻密に描かれていることが分かります。大会ごとにチーム編成が変化し、掛け合い台詞やエンディングの一枚絵で語られる細やかなドラマが、プレイヤーの感情移入を決定的なものにしました。
