『ロックマンエグゼ2』最大の革新要素が、プレイヤーの戦い方に応じてロックマンの能力が変化するスタイルチェンジです。ストーリー中盤以降、約100回のバトルを行うごとに新たなスタイルへの変異が発生します。
スタイルの派生条件は、直近の戦闘行動によって細かくスコアリングされています。チャージショットを多用すればガッツスタイル、チップを多く選んで素早くターンを回せばカスタムスタイル、リカバリーやバリアを駆使すればシールドスタイルへと分岐します。その他にも、メガクラスチップを多く扱う「ブラザースタイル」や、暗殺技術のようなトリッキーな戦法を好む「シャドースタイル」が存在します。
全属性・全スタイルを極めた先に出現する究極の形態がサイトスタイルです。HPが半減するリスクと引き換えに、カスタム画面で常にチップが10枚オープンされ、エアシューズ・シャドー・シールドなどの全スタイル特性を同時に行使できる圧倒的なスペックを誇ります。
