一口にチーズケーキと言っても、製法や配合によって凍結への耐性はまったく異なる。それぞれの個性に合わせたアプローチが欠かせない。
しっかりと熱を通して水分を飛ばしているベイクドチーズケーキは、冷凍保存との相性が極めて良好だ。解凍後も生地の組織が崩れにくく、冷凍庫で2〜3週間保存しても濃厚な風味を損なう心配がほとんどない。一方、高温短時間で表面を香ばしく焦がし、中心部をとろりと仕上げるバスクチーズケーキは、中心のクリーミーなテクスチャーをいかに守るかが勝負となる。急速冷凍を徹底しなければ、あの独特の半熟感が失われてしまう。
湯煎焼きでじっくり火入れするニューヨークチーズケーキは、生地の密度が高く気泡が少ないため、冷凍耐性はトップクラスを誇る。しっかり密閉さえすれば、1ヶ月近く品質をキープすることも難しくない。注意を要するのが、ゼラチン等で冷やし固めるレアチーズケーキだ。解凍時に水分が分離しやすいため、完全解凍を待たず、中心がわずかに凍った「セミフレッド（半解凍）」の状態で食べるのがプロの裏技として定着している。
