私立中高への進学において重要な検討材料となるのが経済面です。実践学園の学費は、東京都内の私立中高における平均的な水準に位置しています。中学の初年度納入金は約100万〜110万円前後、高校は約95万〜105万円前後(入学金・授業料・施設費・諸会費等を含む)となっており、国の高等学校等就学支援金や東京都の授業料軽減助成金制度を活用することで実質負担を軽減できます。
また、学業成績やスポーツ実績に優れた生徒を対象とした実践学園の特待生制度の条件も明確に定められています。中学入試では特待生選抜入試での高得点獲得者、高校入試では内申基準を満たした生徒や併願・推薦特待生試験で基準点を超えた生徒に対し、入学金や授業料の全額免除または半額免除といった手厚いスカラシップが適用されます。入学後も模試や定期考査の成績によって継続審査が行われるため、高いモチベーションを維持して学業に励む原動力となっています。