SNSやネット掲示板などで散見される「美ら海水族館は夕方がガラガラ」という定説は、現在の状況では半分正解で半分誤解といえます。団体ツアーのバスが引く16時以降は確かに大型バスの利用者が減るものの、個人旅行客やレンタカー組が給餌ショーを目当てに集中するため、15:00〜17:00にかけて館内は一時的にピークを迎えます。
本当に混雑を避けて静かな海の世界を堪能したいのであれば、「開館直後の8:30〜10:00」、または「17:30以降の閉館前」の2つの時間帯が最大の穴場です。朝一番に訪れれば、透明度の高い「サンゴの海」に差し込む自然光を独り占めできるほか、撮影時の背景に人が写り込む心配も格段に減ります。
また、お土産選びにも落とし穴があります。水族館の出口付近にあるショップ「ブルーマンタ」は、退館ラッシュとなる15時以降にレジ待ちの大行列が発生します。そこでおすすめなのが、総合休憩所内にある「美ら海プラザ」や公式オンラインショップの併用です。美ら海プラザでは、定番の「紅芋タルト」美ら海限定パッケージや、ジンベエザメのオリジナルぬいぐるみ・文具など人気の高い限定グッズが比較的落ち着いた環境で手に入ります。