子育て世帯が最も注視するポイントの一つが、中学校卒業後の進路実現力です。小野南中学校の通学区域・校区は、主に市場小学校および来住(きし)小学校の卒業生が進学するエリアで構成されています。広大な学区を抱えるため、一部の遠隔地集落に住む生徒に対しては自転車通学が認められており、交通安全指導が徹底されています。
高校入試における小野市立小野南中学校進学実績は、近隣の公立最難関校である兵庫県立小野高等学校(普通科・科学探究科)への合格者を毎年着実に送り出している点が特徴です。同校の生徒たちは、兵庫県第3学区(北播磨・東播磨地域)の制度のもとで受験に臨みます。
小野高校への進学のみならず、地域屈指の実績を持つ三木高校、社高校、加古川東高校、加古川西高校、さらには播磨地区の私立進学校(須磨学園、滝川第二、東洋大姫路など)まで、生徒の学力特性や将来設計に応じた幅広い進路選択が行われています。
兵庫県の公立高校入試では内申点(調査書点)が合否の半分近くを左右するため、定期テストでの安定した得点と授業態度が極めて重要視されます。同校では小規模校ならではのきめ細かな課題添削が行われており、コツコツと学習努力を重ねる生徒が内申点を堅実に確保しやすい仕組みが整っています。