IQ185を超え、かつての手術執刀医や研究者たちすら遥かに凌駕する天才となったチャーリィ。しかし、知性の向上と反比例するように、彼の心は孤立していきます。他人の無知や傲慢さが許せなくなり、かつて優しく見守ってくれた人々との間に深い溝が生まれます。愛する女性、アリスとの関係も、知性の格差によって歪んでいきました。
「無知であることの幸福」と「知ることの孤独」。チャーリィは、自分がかつて愛されていたのではなく、ただ見下され、道化として扱われていた事実に気づきます。知性は彼に世界を理解する力を与えましたが、同時に温かな人間関係を奪い去ってしまったのです。