手の指や爪の生え際周囲にできるイボの直接的な原因は、ヒトパピローマウイルス（HPV）の感染です。子宮頸がんの原因となるハイリスク型HPVとは型が異なり、手にできるイボの多くはHPV-2型、27型、57型などの良性型皮膚感染性ウイルスによるものです。
健康でバリア機能が保たれた健常な角質層には、ウイルスが侵入することはできません。しかし、日常のささいな傷やトラブルがウイルスの侵入口となります。特に手の指における主要な原因因子は以下の通りです。
- ささくれ（爪周囲の逆剥け）をむしる癖：爪のキワは皮膚が薄く、爪周囲炎や微小裂傷が頻発します。ここから侵入したウイルスは爪の根元に入り込み、「爪囲疣贅（そういゆうぜい）」と呼ばれる難治性のイボを形成します。
- 指しゃぶりや爪を噛む癖：唾液による角質のふやけと物理的破損が重なり、小児の指にウイルスを定着させる最大の原因となります。
- 乾燥とアルコール消毒による手荒れ：頻繁な手洗い・消毒作業で皮脂膜が奪われ、目に見えない無数のマイクロクラック（微小亀裂）が生じることで、皮膚の防御壁が決壊します。
- スポーツや工具使用による機械的擦過：ジムのダンベル、鉄棒、作業工具などとの継続的な摩擦が皮膚を傷つけ、接触感染の契機となります。
ウイルスが基底細胞に感染すると、細胞の異常増殖を促しながら数ヶ月から半年以上の潜伏期間を経て徐々に隆起を形成します。感染した患部を触った手で自分の他の指や顔を触ることで自己接種（自家接種）が起き、病変がネズミ算式に増えていく仕組みです。
