インターネット上の検索コミュニティや宿泊予約相談において、今なお頻繁に見受けられるのが「横浜プリンスホテル」と「新横浜プリンスホテル」の混同です。出張や観光で「新横浜駅前のプリンスホテルを予約したつもりが、昔の磯子の思い出と写真が混ざって混乱した」という声が散見されます。
正確な事実として、現在「横浜プリンスホテル」という単独名称のホテルは営業していません。現存しているのは新幹線停車駅に直結する超高層の「新横浜プリンスホテル」のみです。この2棟は運営会社こそ同じ西武グループ（西武・プリンスホテルズワールドワイド）ですが、立地も歴史的文脈もまったく異なる施設です。
もうひとつの誤解は「跡地は完全に更地になり、歴史的遺産はすべて失われた」という言説です。本館棟は解体されたものの、敷地内の中核であった歴史的建造物は手厚く保全されており、今なおその姿を現地で確認することができます。
