ネット上のQ&Aサイトなどでは、「機種変更をするとPayPayカードの連携が切れる」「銀行口座の再登録が必要になる」といった不正確な情報が散見されます。実際には、アカウントに紐付いたチャージ用金融機関口座やPayPayカードの情報はサーバー側で保持されているため、再登録の必要はありません。
一方で、セキュリティの観点から端末側に保存される設定値についてはリセットされる仕様が存在します。その代表例がPayPayオートチャージ設定です。新端末での初回ログイン時、一定条件下でオートチャージ機能が無効化される仕様となっており、レジ前で残高不足に陥るトラブルが報告されています。また、クレジットカード決済時の本人認証（3Dセキュア2.0）や生体認証（パスキー認証）の再紐付けも端末ローカルで再設定が求められるため、買い替え当日の初回決済前に設定画面を確認しておくことが重要です。
