大学の実力を測るもう一つの重要な尺度が、付属病院の臨床水準と卒業生が歩む進路です。
東京都千代田区の好立地に位置する水道橋病院は、1日あたりの外来患者数が国内歯科病院でも群を抜く規模を誇ります。患者目線での口コミ・評判を見ても、「難治性の根管治療や親知らずの抜歯で他院から紹介され、極めて手際よく処置してもらえた」「説明が丁寧で先端設備が整っている」といった高評価が目立ちます。学生にとっては、都心の多様かつ膨大な症例に直接触れられる理想的な臨床実習環境となっています。
さらに、千葉県市川市に展開する市川総合病院の存在は、東京歯科大学の大きな強みです。単なる歯科診療所ではなく、内科、外科、小児科、眼科などを備えた本格的な総合病院であり、角膜移植をはじめとする先端医療でも知られています。歯科学生の段階から「医科歯科連携」や全身管理の重要性を総合病院の現場で体感できるカリキュラムは、他私立歯学部にはない大きなアドバンテージです。
卒業後の進路においても、その優位性は顕著です。1年間の義務である臨床研修医マッチングでは、自大学の水道橋病院や市川総合病院はもちろん、東京医科歯科大学病院（現・東京科学大学病院）や慶應義塾大学病院の歯科・口腔外科へ進む研修医も少なくありません。開業医の子弟が多くを占めるものの、近年は大学院へ進学して学位を取得する層や、総合病院の口腔外科医として確固たるキャリアを築くケースが増加しています。全国の歯科医師会や大学教授陣に張り巡らされた「同窓会（血脇守之助に連なる東京歯科大学同窓会）」の結束力は政財界・医療界でも屈指であり、卒業後の盤石なセーフティネットとして機能しています。
