屋外グラウンドを利用する上で避けて通れないのが悪天候時の対応です。埠頭少年野球場の雨天キャンセルについては、当日の天候およびグラウンドコンディションを管理事務所が判断します。自己都合による勝手なキャンセルはペナルティ対象となる可能性があるため、雨天中止の確認は必ず指定窓口へ電話連絡を入れて指示を仰ぐのが鉄則です。規定の雨天中止と認められたコマは、使用料の還付や振替措置が適用されます。
また、埠頭少年野球場の使用ルールとして、少年野球および指定された競技種目以外での無断使用は禁止されています。近隣環境への配慮からグラウンド外でのウォーミングアップや路上駐車、大声での過度な騒音は厳禁です。利用後にはベース周辺やマウンドの丁寧なトンボ掛け、持ち込んだゴミの完全持ち帰りが義務付けられています。