利用料金のシステムは、一般的な公立スポーツセンターと比較しても非常に利用しやすい水準に設定されています。自治体の福祉施策に基づき、障害者手帳を提示することで本人および介助者1名の利用料が全額免除（無料）、もしくは半額程度に減免される制度が広く導入されています。
一般利用者が単独でトレーニングジムや温水プールを利用する場合でも、公立施設と同等かそれ以下の数百円程度（1回あたり200円〜500円前後）に設定されているケースがほとんどです。民間フィットネスクラブのような高額な月額会費を必要としない点は、大きなメリットと言えます。
また、2026年現在はデジタル障害者手帳アプリ「ミライロID」に対応する施設がほぼ100%に達しており、窓口でスマートフォン画面を提示するだけでスムーズに減免手続きが完了します。
