ストヘス区での激闘において、エレンの巨人化と調査兵団の連携により退路を断たれたアニは、捕獲される直前に自らの肉体を球状の硬質物質で覆いました。この水晶体の封印理由は、パラディ島勢力による過酷な尋問・拷問を防ぐと同時に、マーレや「九つの巨人」に関する軍事機密の漏洩を完全に遮断するための最終防衛策でした。
物理的な破壊手段を持たなかった調査兵団は、地下深くに彼女を幽閉し、監視を続けることしかできませんでした。アニは意識を保ちながらも身動きが取れない仮死状態のまま、約4年間という途方もない歳月を水晶体の中で過ごすことになります。この沈黙の期間、彼女に語りかけ続けたのが調査兵団のアルミン・アルレルトとヒッチ・ドリスでした。
事態が劇的に動いたのは、エレンが「始祖の巨人」の力を完全掌握し、パラディ島のすべての硬質化を強制解除した瞬間です。壁の崩壊と同時にアニの水晶体も融解し、床に倒れ伏す形でアニの復活シーンが描かれました。息も絶え絶えになりながらも、再び動き出した彼女の瞳に宿っていたのは、変わり果てた世界に対する深い困惑と、父への思慕でした。