店舗の所在地は「神奈川県藤沢市南藤沢19-17」であり、JR東海道線・小田急江ノ島線・江ノ島電鉄の各改札が集まる藤沢駅南口から、ペデストリアンデッキを降りて徒歩3〜5分という絶好のアクセスを誇ります。南口本通り周辺の飲食街や商業ビルが立ち並ぶ一角に位置しており、歩行者導線としては非常にスムーズです。
一方、車でアクセスしようと考えているドライバーは事前の情報整理が欠かせません。メガドンキのような郊外型ロードサイド店とは異なり、ドン・キホーテ藤沢駅南口店の提携駐車場は敷地内には用意されていません。車で訪れる場合は、南藤沢エリアに点在する時間貸しコインパーキング（タイムズや名鉄協商など）を自己負担で利用するのが基本ルートとなります。
自転車や原付バイクを利用する際にも配慮が必要です。ドン・キホーテ藤沢駅南口店の駐輪場に関して、店舗正面の歩道は道幅が限られており、放置自転車の取り締まり重点区域にも指定されています。店頭への無断駐輪は即時撤去の対象となるリスクがあるため、近隣の藤沢市営駐輪場（南口地下駐輪場など）や近隣ビルの時間貸し駐輪スペース（最初の1〜2時間無料のスポットなど）を賢く組み合わせる立ち回りが求められます。
