物語は、スカンジナビア全土を突如襲った「死の雨」から幕を開けます。大雨の中に含まれる未知のウイルスに触れた人間は、激しい痙攣と吐血を起こして数分で命を落とすという異常事態が発生。科学者の父親フレデリックは、妻と娘のシモネ、そして重い病を患っていた幼い息子ラスムスを地下のハイテクシェルターへ避難させ、「息子を守れ、彼はすべての鍵だ」と言い残して姿を消します。
外界から完全に遮断されたシェルターの中で、姉弟は6年もの歳月を過ごします。食糧が尽きかけ、地上の様子を確かめるために外へ出た二人は、文明が完全に崩壊し、生き残った生存者たちが略奪を繰り返す荒廃したスカンジナビアを目の当たりにしました。
二人はマルティンをはじめとする若き生存者グループと合流し、父親の手がかりと安全な場所を求めて旅を続けます。しかし、旅が進むにつれて明らかになったのは、ラスムスの体内こそがウイルスの発生源であり、彼自身が感染しながらも発症しない「唯一の免疫保持者」であるという残酷な真実でした。
