車で来館する場合、常磐自動車道「桜土浦IC」から約10分、首都圏中央連絡自動車道（圏央道）「つくば中央IC」から約10分と道路アクセスは極めて良好です。しかし、大規模なつくば国際会議場 学会や市民イベントの開催日は、専用駐車場の確保が最大の関門となります。
施設直結のつくば国際会議場 駐車場は、地下駐車場および敷地内平面駐車場を含めて合計約180台が収容可能です。料金は一般利用の場合、最初の1時間まで無料、以後30分ごとに100円（最大料金設定あり・催事主催者規定により異なる場合あり）とリーズナブルに設定されています。
ただし、大ホールが満席になるようなイベントでは午前9時前後に満車となるケースが散見されます。万が一の満車時に備え、徒歩3〜5分圏内にある「竹園ショッピングセンター周辺コインパーキング」や、つくば駅前の大型立体駐車場（NPC24Hつくば都市第2駐車場など）を第2候補としてマークしておくことで、遅刻リスクをゼロに抑えられます。
