ひだホテルプラザ最大の武器は、地下と最上階にそれぞれ趣の異なる大浴場を配した「館内湯めぐり」です。敷地内から湧出する自家源泉「飛騨高山温泉 飛天の湯」は、肌触りが柔らかく、湯冷めしにくい泉質（弱アルカリ性単純温泉）として定評があります。
最上階「飛天の湯」展望露天風呂＆ジャグジー
晴天時には遠く北アルプスの雄大な山々を、夜には澄み切った満天の星空を眺めながら湯浴みが楽しめるパノラマ露天風呂です。併設されたジャグジーバスやシルキーバスは女性層からの支持が厚く、四季折々の飛騨の風を感じながら極上のリラクゼーションを体験できます。
地下「木 interstitial 浮世風呂」と低温サウナ
樹齢数百年の銘木をふんだんに使用した地下大浴場は、木の香りに包まれる落ち着いた空間です。サウナ施設も併設されており、旅の疲労回復や「ととのい」を求める温泉ファンにも好評を博しています。
なお、外来者向けの日帰り温泉営業も行っており、料金は大人約1,000円〜1,500円（タオル付、利用時間帯や特別期間により変動あり）で利用可能です。高山散策の合間に立ち寄り湯として利用する旅行者も多く見られます。
