物語の大きな転換点となったキメラアント編では、敵対する敵キャラクターたちにも爆発的な支持が集まりました。キメラアント編キャラクター人気において特筆すべきは、王メルエムと軍儀の盲目少女コムギの関係性です。
人類を家畜と見なしていた冷酷な王が、コムギとの対話を通じて「個の尊厳」や「愛」を学び、最期はひとりの生命として彼女の隣で静かに息を引き取る結末は、漫画史に残る名場面として語り継がれています。また、狂気的な忠誠心と無垢な残酷さを見せたネフェルピトーや、武人としての誇りを貫いたモントゥトゥユピーなど、敵側の内面的成熟を描き切ったことが作品全体の評価を決定づけました。
ハンターハンター読者ネットの反応をSNSや掲示板などで調査すると、連載再開時や単行本発売のたびに「誰が一番推せるか」という論争が再燃します。特に2024年から2026年にかけて進行する王位継承編では、クラピカの孤軍奮闘に加え、第4王子ツェリードニヒのような極悪でありながら底知れない知性を持つ新キャラクターへの注目度が急上昇しており、ハンターハンター最新人気順位まとめの議論は今なお活発に続いています。