知性派としてのキャリアを着実に広げる中、プライベートでも大きな節目を迎えています。2009年、44歳の時に5歳年下の会社員男性と結婚しました。
二人の馴れ初めは、愛犬の散歩仲間としての出会いでした。愛犬家同士として公園で顔を合わせるうちに親交を深め、約2年の交際期間を経てゴールイン。派手な芸能界に身を置きながらも、等身大の価値観を共有できるパートナーとの穏やかな日常が、彼女の精力的な活動を支えています。
大学院への進学や研究活動に対してもいとうまい子の夫は深い理解と支援を惜しまず、夫婦で互いの挑戦を認め合う良好な関係性が続いています。