一度に大量に仕込むしそジュースだからこそ、正しい保存管理を行わなければカビや発酵による劣化を招きます。糖度と保管環境ごとの保存期間の目安は以下の通りです。
【冷蔵保存の場合（推奨）】：約3ヶ月〜6ヶ月
煮沸消毒または食品用アルコールで消毒したガラス瓶に熱いうちに充填し、密閉して冷蔵庫の奥（温度変化の少ない場所）で保管します。砂糖分量を減らさず黄金比通りに作った場合、半年近くクリアな状態を維持できます。
【冷凍保存の場合（最長保存）】：約1年間
翌年のしそシーズンまで楽しみたい場合は冷凍保存が最適です。濃縮液は糖度が高いため、冷凍庫に入れても完全なカチコチには固まらず、シャーベット状になります。製氷皿でキューブ状に凍らせてからフリーザーバッグに移し替えておけば、飲みたい時にグラスに1〜2個放り込んで炭酸水を注ぐだけで即座に本格ドリンクが完成します。
【常温保存の危険性】：
密閉脱気処理を施していない家庭用の手作りシロップを常温放置するのは避けてください。特に夏季の室内は25℃を超え、酵母菌の増殖による容器の破裂やカビ発生の危険が高まります。
