美秀美術館へのアクセスは、公共交通機関を利用するか、自家用車・レンタカーを利用するかでルートが大きく異なります。
公共交通機関を利用する場合のメインルートは、JR琵琶湖線「石山駅」からのアクセスです。石山駅南口のバス乗り場（3番のりば）から、帝産湖南交通バス「MIHO MUSEUM行き」が運行されており、所要時間は約50分です。京都駅から石山駅まではJR新快速で約14分であるため、京都観光の延長線上として日帰り往復する外国人観光客や遠方からの旅行者にも非常に分かりやすい動線となっています。
自家用車で向かう場合は、新名神高速道路の「信楽IC」から約15分、または「草津田上IC」から約20分です。無料の大規模駐車場（普通車約300台収容）が完備されていますが、春の桜開花ピーク時や紅葉シーズンは周辺道路が一本道となるため、週末の午前10時〜午後14時は渋滞が発生しやすくなります。混雑期は開館直後の午前中に到着するスケジュールを組むことが賢明です。
