メガ店舗ゆえに「目的の本がどこにあるか見つからない」という課題を解消するのが、館内各所に設置された検索端末「KINO-NAVI(キノナビ)」および公式スマートフォンアプリです。紀伊國屋書店新宿本店の在庫検索システムは、リアルタイムで在庫の有無だけでなく、棚番号と詳細な位置マップを即座にレシート印刷または画面表示してくれます。取り置きサービス「店舗受取」を事前にWEBから指定しておけば、1階の受取カウンターで並ばずに受け取ることも可能です。
館内での思索や読書をサポートするカフェスペースも見逃せません。落ち着いた照明と心地よい座席が用意された喫茶エリアでは、購入したばかりの本のページをめくりながら上質なドリップコーヒーや軽食を楽しめます。また、7階・8階およびホールで開催されるイベント・サイン会は、文芸作家からカルチャー著名人まで多彩な顔ぶれが登壇し、整理券の争奪戦が起きるほどの熱狂を生み出しています。